A la palabra morata, y su diminutivo moratilla, es posible hacerla proceder del sustantivo mora y considerar que se trata de definir alguna semejanza con este fruto silvestre, por ejemplo su color. Mora encuentra su etimología en el sustantivo neutro latino morum (= mora, zarzamora) formada a partir de su nominativo plural, mora.

Algún autor considera que los topónimos con este inicio están relacionados con la raíz prerromana Mor- (= roca, monte, montículo rocoso). Ésta parece ser la explicación que más se adapta al tipo de terreno de este paraje.

La Moratilla no se encuentra registrada en documentos del siglo XVIII.